การใช้ยาลินโคไมซินร่วมกับสเปกติโนไมซินจะเสริมฤทธิ์กัน และในบางกรณีอาจเสริมฤทธิ์กันอย่างมีประสิทธิภาพ สเปกติโนไมซินออกฤทธิ์ยับยั้งการเจริญเติบโตของแบคทีเรีย หรือฆ่าแบคทีเรีย ขึ้นอยู่กับขนาดยา โดยส่วนใหญ่จะออกฤทธิ์ต่อแบคทีเรียแกรมลบ เช่น แคมปิโลแบคเตอร์ อี. โคไล ซัลโมเนลลา และไมโคพลาสมา ส่วนลินโคไมซินออกฤทธิ์ยับยั้งการเจริญเติบโตของแบคทีเรีย โดยส่วนใหญ่จะออกฤทธิ์ต่อแบคทีเรียแกรมบวก เช่น สแตฟิโลค็อกคัส สเตรปโตค็อกคัส และไมโคพลาสมา อาจเกิดการดื้อยาข้ามกลุ่มระหว่างลินโคไมซินกับยาในกลุ่มมาโครไลด์ได้